主凶：朝香宫鸠彦、松井石根、谷寿夫、柳川平助、中岛今朝吾
1937年七七事变后，日本对中国全面大规模侵略。同年8月至11月，日军在上海及周边地区展开淞沪会战。11月5日，日军侧翼在杭州湾的全公亭、金山卫间登陆，战局急转直下。11月8日，蒋介石下令全线撤退，四天后上海失守，日军趁势分三路急向南京进犯。
由于下达撤退命令过于仓促，后方国防工事交接发生失误，随着日军轰炸机的大范围轰炸，撤退演变为大溃败，日军主力一路顺利到达南京。 蒋介石期望保卫首都的作战对纳粹德国的外交调停有利，并且以为能够等到苏联的军事介入，于是决定“短期固守”南京1至2个月。1937年11月20日，中国国民党政府发表《国民政府移驻重庆宣言》，政府机关、学校纷纷迁往内地，很多市民也逃离了南京。在6月有101.5万城乡居民的南京市，到了12月初的常住人口据估计还有46.8万至56.8万人，这还不包括军人和从前方逃亡到南京的难民。
蒋介石于11月26日任命唐生智为南京卫戍军司令长官，负责南京保卫战。
1937年12月1日，日军攻占江阴要塞，同日，日军下达进攻南京的作战命令。12月2日，江阴防线失守中国海军主力第一舰队和第二舰队在中日江阴海战中被全数击沉，作为南京国民政府唯一一道拱卫京畿的水上屏障失守。12月10日日军发起总攻，12月12日唐生智下达突围、撤退命令，中国军队的抵抗就此瓦解。
13日晨，日军攻入南京城，开始了长达四十多天的南京大屠杀。
日军进城兵力约5万人，除了对南京居民随时随地任意杀戮之外，还对解除武装的军警人员进行若干次大规模的“集体屠杀”。大规模屠杀方法有机枪射杀、集体活埋等，手段极其残忍。
12月15日（日军占领第3天）：已放下武器的中国军警人员3000余人被集体解赴汉中门外用机枪密集扫射，多人当场遇难，负伤未死者亦与死者尸体同样遭受焚化。当日夜晚，押往鱼雷营的中国平民及已解除武装的中国军人9000余人被日军屠杀。又在宝塔桥一带屠杀3万余人。在中山北路防空壕附近枪杀200人。
12月16日（日军占领第4天）：位于南京安全区内的华侨招待所中躲避的中国男女难民5000余人被日军集体押往中山码头，双手反绑，排列成行。日军用机枪射杀后，弃尸于长江以毁尸灭迹。5000多人中仅白增荣、梁廷芳二人于中弹负伤后泅至对岸，得免于死。日军在四条巷屠杀400余人，在阴阳营屠杀100多人。
12月17日（日军占领第5天）：中国平民3000余人被日军押至煤炭港下游江边集体射杀。在放生寺、慈幼院避难的400余中国难民被集体射杀。
12月18日（日军占领的第6天），日军将从南京城内逃出被拘囚于幕府山的中国难民男女老幼共57418人，除少数已被饿死或打死，全部用铅丝捆扎，驱集到下关草鞋峡，用机枪密集扫射，并对倒卧血泊中尚能呻吟挣扎者以乱刀砍戮。事后将所有尸骸浇以煤油焚化，以毁尸灭迹。此次屠杀仅有伍长德一人被焚未死，得以逃生。大方巷难民区内日军射杀4000余人。
据1946年2月中国南京军事法庭查证：日军集体大屠杀28案，19万人，零散屠杀858案，15万人。日军在南京进行了长达6个星期的大屠杀，中国军民被枪杀和活埋者达30多万人。
1937年12月13日，《东京日日新闻》报道两名日本军官的“杀人竞赛”。日军第十六师团中岛部队两个少尉军官向井敏明和野田毅，彼此相约“杀人竞赛”，商定在占领南京时，谁先杀满100人为胜者。他们从句容杀到汤山，向井敏明杀了89人，野田毅杀了78人，因皆未满100，“竞赛”继续进行。12月10日中午，两人在紫金山下相遇，彼此军刀已砍缺了口。野田毅杀了105人，向井敏明杀了106人。又因确定不了是谁先达到杀100人之数，决定这次比赛不分胜负，重新比赛谁杀满150名中国人。这些暴行都一直在报纸上图文并茂连载，被称为“皇军的英雄”，由于平台规则，照片太过暴力，感兴趣的小伙伴自行搜索查看。
日军侵占南京期间强奸了成千上万的妇女，他们不分昼夜并在受害妇女的家人面前施行强暴。有些妇女被日军强奸了好几次，往往有妇女受不住日军的折磨而死。除此之外，日军还强迫乱伦行为，当时发生的强暴案可能超过20000宗。
日本侵略者占领南京以后，派出特工人员330人、士兵367人、苦工830人，从1938年3月起，花费一个月的时间，每天搬走图书文献十几卡车，共抢去图书文献88万册，超过当时日本最大的图书馆东京上野帝国图书馆85万册的藏书量。
南京大屠杀中抢劫和纵火造成严重财产损失。南京国际救济委员会的报告称：“南京31%的建筑被烧毁；店铺被毁比例更高；日军损毁及抢劫造成高达1亿法币的直接损失；南京周边公路沿线的农村地区被洗劫殆尽，并陷入缺少种子、牲畜、劳力和工具的困境中，播种的粮食作物仅为平常年份的10%。
据国际委员会委员斯迈思所作调查统计：全市房屋，有24%毁于纵火焚烧；城外有62%的房屋被烧毁，通济门外被烧房屋高达78%；在江宁、句容、溧水、江浦和六合（半县）四个半县中，共有30.08万间房屋被毁，占这些地区房屋总数的40%，其中多数是被烧毁的。
朝香宫鸠彦：日本皇族。1937年12月7日，赶到南京，接替松井石根成为南京临时攻城指挥。其签署了一道“机密，阅后销毁”的密令：“杀掉全部俘虏！”成为日军暴行最直接的点火点。战后靠着皇族身份和美国人的庇护，得以逃过一劫，并以94岁高龄寿终正寝。
松井石根：二战甲级战犯，时任日军上海派遣军司令、华中方面军司令，指挥所部攻陷上海、南京，并纵容部下制造了南京大屠杀惨案。远东国际法庭在东京审判定为死罪，1948年12月23日零时，松井石根在东京巢鸭刑务所被送上绞刑架，十二分三十秒后松井石根被确认死亡，下图为松井石根入南京城照。
武藤章：二战甲级战犯，时任日军华中方面军副参谋长，负责日军在南京的宿营安排。武藤章宣布南京城外宿营地不足，日军官兵可以在南京市内随意选择宿营地。此令一出，数万兽兵冲进南京，南京就此成为炼狱。1948年12月23日零点，武藤章被送上绞刑架，零点10分确认死亡。下图为武藤章在远东国际法庭受审。
谷寿夫：乙级战犯，时任日军第6师团中将师团长。1937年12月13日，第六师团攻破德械第88师防守的中华门，率先攻入南京市，给部下下达了“打下南京放假一星期”的指示。直到同年12月22日，第六师团奉命调到安徽南部进行“清剿作战”，该师团在南京的暴行才得以停止。1946年2月作为战犯被盟军总司令部逮捕移交中国，经南京军事法庭1年多的审判，于1947年4月26日被枪决。除了在南京犯下大屠杀罪行之外，谷寿夫和他的第6师团还曾在日俄战争期间有过虐杀俄国战俘的丑闻，并在菲律宾参与过巴丹死亡行军，感兴趣的小伙伴可以自行搜索查看。下图为谷寿夫在南京军事法庭受审。
柳川平助：时任日军第10军司令官，其麾下各部是南京大屠杀的主要制造者。1945年1月22日，在日本行将败北前夕病死，后被远东军事法庭追加为乙级战犯。
柳川平助，谷寿夫的上级
中岛今朝吾：时任日军第16师团师团长。他所率的16师团在南京大屠杀中杀害中国人民达24万人，占屠杀总遇害人数的十分之八。其中包括最著名的几次万人以上大屠杀，包括燕子矶、草鞋峡、鱼雷营、江东门屠杀，以及紫金山活埋3000战俘的事件。1945年10月25日，因病而死，逃脱了审判。
野田毅、向井敏明：1937年11月30日，《东京日日新闻》首次报道了向井敏明少尉和野田毅少尉进行百人斩竞赛的消息，向井敏明使用军刀野蛮地砍杀了中国军民106人，野田毅砍杀了中国军民105人。1945年日本投降后，参加东京远东国际军事法庭对日战犯审判的中国代表高文彬无意间发现了关于这次杀人比赛的相关报道，并立即向中国南京国民政府通告，此二人后被押赴中国受审。1948年1月28日，野田毅及向井敏明被押往雨花台刑场执行死刑。
